Introdução: As lesões do manguito rotador consistem em um dano inflamatório e degenerativo que acometem os tendões da bainha dos rotadores. A nicotina é um potente vasoconstritor que diminui o suporte de oxigênio na zona crítica de Codman. A fisioterapia atua na diminuição da dor, no fortalecimento muscular e estabilização da musculatura escapular. Métodos: Ensaio clínico não randomizado com 24 pacientes com lesão do manguito rotador (MR) que receberam tratamento fisioterapêutico três vezes por semana durante quatro semanas. Foram avaliados, antes e após a intervenção, o nível de dor, o consumo de cigarro, a amplitude de movimento (ADM), força muscular e funcionalidade. Os sujeitos foram estratificados em grupo não fumante (n=12) e fumante (n=12). Resultados: Verificou-se uma redução significativa da dor após o protocolo de intervenção em todos os sujeitos do estudo (p<0,05). Os questionários de funcionalidade apresentaram melhora apenas no grupo não tabagista (p<0,05). Os sujeitos tabagistas apresentaram menor ADM de flexão ativa de ombro bilateral, uma menor abdução em ombro esquerdo ao final do protocolo (p<0,05). Ambos grupos aumentaram significativamente a força muscular de ombro bilateralmente. Conclusão: O hábito de fumar cigarro piora os resultados funcionais após um programa de fisioterapia para lesões do MR do ombro.